O programa possui como missão formar mestres capazes de realizar pesquisas históricas utilizando variado repertório de fontes, conceitos e métodos do campo da História Social. Sua missão é igualmente gerar estudos que possam elucidar experiências, memórias e identidades de diversos sujeitos ou coletividades, alargando o conhecimento já existente sobre continuidades e descontinuidades nas relações sociais de variados lugares, com especial atenção ao espaço amazônico e suas conexões com as dinâmicas nacionais e globais.

O PPGH, organizado na forma de Mestrado Acadêmico, visa proporcionar formação acadêmica a portadores de título de graduação, capacitando-os para a pesquisa e para a docência na área de História por meio do aprimoramento de conhecimentos imprescindíveis ao desenvolvendo do espírito crítico e da produção e científica.

O PPGH pretender formar mestres em História Social capazes de realizar pesquisas históricas com consistência teórica e metodológica e de promover aprendizagens históricas, seja atuando em espaços de educação patrimonial, seja ensinando História da educação básica ao ensino superior. O Programa igualmente espera que seus egressos atuem na sociedade em que vivem no sentido de favorecer a emancipação dos sujeitos sociais de todas as formas de opressão.