Compete ao Departamento de Gestão Orçamentária (DGO) a execução das seguintes atribuições:
- Desenvolver ações para planejamento, distribuição e controle dos recursos orçamentários da UNIFAP;
- Subsidiar a PROPLAN com informações e indicadores necessários ao gerenciamento eficaz dos recursos orçamentários;
- Gerenciar o planejamento dos custos operacionais.
O DGO é formado pelas seguintes unidades:
- Divisão de Programação Orçamentária (DIOR)
- Divisão de Custos Operacionais (DICOP)
- Divisão de Convênios (DICONV)
- Divisão de Execução Orçamentária (DIVEXORC)