A Comissão Interna de Supervisão (CIS) é composta por cinco representantes eleitos em Assembleia Geral da categoria dos Técnico-administrativos em Educação da UNIFAP para mandato de dois anos, conforme estabelece a Portaria-2752/2016.
- Rafael Haussler Saldanha – Coordenador
- Lidiane Ferreira Rodrigues – Coordenadora Adjunta
- Lucicléa de Castro Pereira – Secretária
- Adriano Silva de Souza
- Thais Araújo dos Santos