Atualmente o CLII conta com dois tipos de bolsas de estudo:
1- Bolsa Permanência / Programa Bolsa Permanência (PBP): Concessão de auxílio financeiro a estudantes matriculados em instituições federais de ensino superior em situação de vulnerabilidade socioeconômica e para estudantes indígenas e quilombolas. Mais informação: http://permanencia.mec.gov.br/
2- Bolsa do Pet / Programa de Educação Tutorial (PET): O referido programa é desenvolvido por grupos de estudantes, com tutoria de um docente, organizados a partir de formações em nível de graduação em instituições de ensino superior orientados pelo princípio da indissociabilidade entre ensino, pesquisa e extensão e da educação tutorial. É coordenado pelo Prof. Dr. João Batista Gomes de Oliveira desde 2010. Mais informações: http://portal.mec.gov.br/index.php?option=com_content&view=article&id=12223&Itemid=481